Implementação é permanente e complexa, interagindo múltiplos fatores sociais que exigem pesquisa responsiva aos entraves reais das escolas, não conformidade delas a padrões ideais. 

Múltiplos fatores interagem na escola, permitindo que pesquisa estabeleça padrões ideais que, se não atendidos, indicam implementação inadequada independentemente de contextos locais.

Contextos escolares, embora diversos, permitem avaliação de programas através de protocolos padronizados que capturam elementos comparáveis entre diferentes realidades de implementação.

Pesquisa responsiva considera entraves escolares, mas a efetividade de programas permanece avaliável isoladamente quando metodologicamente bem controlada. 

Ciclos de políticas e projetos (começo, meio, fim) estruturam também a implementação nas escolas, possibilitando avaliação ao término de cada fase definida formalmente.

O Saeb utiliza testes e questionários para avaliar os níveis de desempenho do conjunto de estudantes avaliados.

Os níveis de desempenho estão descritos e organizados, de modo crescente, em escalas de proficiência de língua portuguesa e matemática para cada uma das etapas avaliadas.

Os testes de língua portuguesa e matemática seguem a BNCC, de 2017.

Uma amostra de estudantes do 9º ano também faz testes de ciências humanas e ciências da natureza, a partir do Saeb 2019.

No ensino fundamental e ensino médio, os diretores e secretários de educação respondem a questionários eletrônicos. Já os demais professores e estudantes respondem a questionários de papel.